Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA13P31271 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms