Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms