Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms