Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms