Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2AP24928 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms