Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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PTPRDP23468 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRDP23468 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PTPRDP23468 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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