Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms