Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms