Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
O00370 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
O00370 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
O00370 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms