Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms