Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SRRM4A7MD48 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SRRM4A7MD48 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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