Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM3A6NNA2 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms