Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms