Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD54L2Q9Y4B4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD54L2Q9Y4B4 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms