Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms