Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms