Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms