Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms