Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EMILIN3Q9NT22 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMILIN3Q9NT22 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms