Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRHQ9HD43 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRHQ9HD43 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRHQ9HD43 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRHQ9HD43 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRHQ9HD43 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRHQ9HD43 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRHQ9HD43 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRHQ9HD43 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRHQ9HD43 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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