Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PLXNA4Q9HCM2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms