Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP58Q9BVL2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms