Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms