Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MCMBPQ9BTE3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms