Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM175Q9BSA9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms