Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIN3AQ96ST3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms