Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms