Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP13Q92995 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP13Q92995 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms