Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113Q902F9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms