Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTTNBP2Q8WZ74 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms