Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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