Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms