Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms