Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZNF549Q6P9A3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF549Q6P9A3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF549Q6P9A3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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