Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RTL6Q6ICC9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RTL6Q6ICC9 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RTL6Q6ICC9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RTL6Q6ICC9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL6Q6ICC9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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