Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FRMPD1Q5SYB0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms