Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms