Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms