Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SFT2D3Q587I9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D3Q587I9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D3Q587I9 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D3Q587I9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D3Q587I9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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