Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COBLL1Q53SF7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms