Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms