Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTXN3Q4LDR2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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