Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms