Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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