Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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