Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NRF1Q16656 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms