Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CTF1Q16619 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CTF1Q16619 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CTF1Q16619 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CTF1Q16619 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CTF1Q16619 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CTF1Q16619 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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