Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RAB39AQ14964 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms