Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EBI3Q14213 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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