Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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